A programban Solid Snake-et, egy titkosügynököt alakítunk, akinek egy szigetre kell beszivárognia, hogy megmentse a terroristák által túszul ejtett embereket, és elpusztítson egy Metal Gear nevű szerkezetet, mely a terroristák (akik ráadásul Snake régi csapatának tagjai) kezére került.

A remek történetnek, izgalmas átvezető videóknak és a profi szinkronnak köszönhetően gyakran olyan érzése van az embernek, mintha egy jó filmet nézne. A játék központi eleme a lopakodás, mivel Snake nem valamilyen egyszemélyes hadsereg. Muszáj rejtve maradni az ellenfelek elől, mivel ha azok riadót fújnak, akkor nem lesz egyszerű túlélni az összecsapásokat.

A Metal Gear Solidnak készült egy fejlettebb grafikájó remake-je is, a GameCube-exkluzív Metal Gear Solid: The Twin Snakes.