Több kisebb összecsapás, nyomozás és néhány platformszekció után a játékosok rátaláltak a Joker rejtekhelyére, ahol egy elrabolt doktort kell kiszabadítanunk. A dolgot persze sikeresen teljesítjük, majd útba vesszük Joker szobáját, válaszok után kutatva, de ezek helyett egy meglepetés vár ránk. Sípoló EKG monitorok és egy zokogó Harley Quinn fogad minket: a Joker meghalt.
Természetesen nem szabad elfelejteni, hogy a Batman-univerzum legismertebb és egyik leginkább kedvelt karakteréről van szó, s ennél fogva nem valószínű, hogy már a játék elején elbúcsúzunk tőle. A nagy kérdés tehát, az hogy vajon miért akarja elhitetni mindenkivel, hogy ő halott?