"Nagyon óvatosnak kell lenned, ha nem akarsz képkocka-veszteséget előidézni az egymástól nagy távolságban lévő játékosok között, akiket csak az internet köt össze." -- magyarázta az IGN-nek Mijamotó -- "Mivel azonban a Pikminben egyszerre sok kicsi lényre kell odafigyelni, akiknek a helyzete kulcsfontosságú a játék szempontjából, nagyon bonyolult lenne szinkronizálni a játékmenetet. Ezért úgy döntöttünk, hogy inkább a helyi multira koncentrálunk, online játék nem lesz a Pikmin 3-ban."
Bár manapság egész online világokat szoktak szinkronizálni a fejlesztők, melyekben több tízmillió játékosnak fontos a térbeli helyzete, a Nintendo szerint ez akkora gond, hogy a Pikmin 3-ban inkább nem kap helyet. Szomorú, mert maga a játék az amúgy elég gyenge show legjobb pillanatait idézte: fantasztikusan nézett ki, hangulatosnak és gondolkodtatónak tűnt, ráadásul egyedüliként csillogtatta meg a különös kontrollerben rejlő lehetőségeket.